On trouve dans la Finca Chiquihuat :
- des arbres à bois : le cenícero, le guachipilín, le conacaste, le châtaignier, le volador, le cèdre, le funera, le guayacán, l'ébène, le ciricote, le madrecacao, l'acacia mangium, le poró, le tihuilote, l'hormigo, le carreto gavilán, le bouleau, le chêne.
- et une grande variété d’arbres fruitiers : le jacquier, le loquat, le zapote, le guaycume, le paterna, le manguier (7 variétés), le citronnier, le cocotier, le goyavier, l’anacardier (noix de cajou), le morro, le caimito, l’avocatier, manzanita de agua, ojushte. On peut également mentionner le cushtan et le patashtes (theobroma bicolore), qui appartiennent à la même famille que le cacaoyer.
Tous ces arbres forment une forêt d’ombrage protectrice permettant aux cacaoyers d'être productifs et en bonne santé.
