Coffee Villages a été créé par Tom Bagaza et sa femme Sylvia en 2007. Avant de s’investir dans le café, Tom a travaillé dans le cadre de projets de développement de l'USAID (United States Agency for International Development,) pendant 9 ans. Tom s'est investi sur le projet PEARL et SPREAD de l'USAID entre 2006 et 2014. À travers ces deux projets, il a travaillé directement avec les producteurs de café en les aidant à s'organiser en coopératives, à développer leurs plans d'affaires et à professionnaliser leur gestion. C'est au cours de cette période que Tom a été témoin de la transformation de la vie des agriculteurs et de leurs communautés grâce à l'amélioration de la qualité du café et du commerce direct. Un modèle que Tom rêvait d'imiter dans sa communauté - le village de Taba.
En 2011, le couple a rencontré Mark Zchesch, un pasteur australien qui mène des actions humanitaires pour soutenir les enfants défavorisés au Rwanda. Partageant les mêmes valeurs sociétales, Mark, Tom & Sylvia ont décidé de développer ensemble un projet pour améliorer la vie des agriculteurs à travers la production de café.